Placeholder image of a protein
Icon representing a puzzle

998: 80 Residue Monomer Design: SS Design

Closed since over 11 years ago

Intermediate Overall Design

Summary


Created
October 15, 2014
Expires
Max points
100
Description

In natural proteins, different amino acids show different propensities for forming secondary structures like alpha helices and beta strands. This puzzle includes a new SS Design filter that restricts the use of GLY residues in helices and sheets. There are several other filters in effect; see the puzzle comments for details. The Baker Lab will run folding predictions on your solutions for this puzzle, and those that perform well will be synthesized in the lab. Remember, you can use the Upload for Scientists button for up to 5 designs that you want us to look at, even if they are not the best-scoring solutions!

Top groups


  1. Avatar for xkcd 21. xkcd 1 pt. 6,864
  2. Avatar for DSN @ Home 22. DSN @ Home 1 pt. 6,829
  3. Avatar for Boinc.be 23. Boinc.be 1 pt. 5,845
  4. Avatar for Repro-men 24. Repro-men 1 pt. 2,893
  5. Avatar for Geekdo 25. Geekdo 1 pt. 0

  1. Avatar for BitSpawn
    1. BitSpawn Lv 1
    100 pts. 10,251
  2. Avatar for Museka 2. Museka Lv 1 98 pts. 10,199
  3. Avatar for nemo7731 3. nemo7731 Lv 1 96 pts. 10,149
  4. Avatar for spmm 4. spmm Lv 1 94 pts. 10,042
  5. Avatar for johnmitch 5. johnmitch Lv 1 92 pts. 10,039
  6. Avatar for retiredmichael 6. retiredmichael Lv 1 90 pts. 9,961
  7. Avatar for stomjoh 7. stomjoh Lv 1 88 pts. 9,953
  8. Avatar for grogar7 8. grogar7 Lv 1 86 pts. 9,945
  9. Avatar for dcrwheeler 9. dcrwheeler Lv 1 84 pts. 9,940
  10. Avatar for spvincent 10. spvincent Lv 1 82 pts. 9,930

Comments


bkoep Staff Lv 1

Residue IE Score: Monitors that all PHE, TYR, and TRP residues are scoring well.

Core Existence: Ensures that at least 35% of the residues are buried in the core of your design.

Fragment Score: Scans for parts of your design that are unlikely to fold up naturally. Use Rebuild and Remix tools to fix these regions of your design!

Secondary Structure: Checks that no more than 50% of residues are in helices; penalties are incurred if greater than 50% of residues form helices.

Secondary Structure Design: Penalizes GLY residues in helices and sheets.

Natashuot39 Lv 1

Aggiornamento rivoluzionario del software SEO / SMM "XRumer 19.0 + XEvil":
captcha regignizing di Google (ReCaptcha-2 e ReCaptcha-3), Facebook, BitFinex, Bing, Hotmail, SolveMedia, Yandex,
e più di 12000 altri tipi di captcha,
con la massima precisione (80..100%) e la massima velocità (100 img al secondo).
È possibile utilizzare XEvil 5.0 con qualsiasi software SEO / SMM più popolare: iMacros, XRumer, GSA SER, ZennoPoster, Srapebox, Senuke e più di 100 altri programmi.

Interessato? Ci sono molti video introduttivi su XEvil su YouTube.
Arrivederci ;)

XEvil Net

Natashuot39 Lv 1

Aggiornamento rivoluzionario del software SEO / SMM "XRumer 19.0 + XEvil":
captcha regignizing di Google (ReCaptcha-2 e ReCaptcha-3), Facebook, BitFinex, Bing, Hotmail, SolveMedia, Yandex,
e più di 12000 altri tipi di captcha,
con la massima precisione (80..100%) e la massima velocità (100 img al secondo).
È possibile utilizzare XEvil 5.0 con qualsiasi software SEO / SMM più popolare: iMacros, XRumer, GSA SER, ZennoPoster, Srapebox, Senuke e più di 100 altri programmi.

Interessato? Ci sono molti video introduttivi su XEvil su YouTube.
Arrivederci ;)

XEvil Net

Andreiogd Lv 1

Ввод воды из скважины в дом в Минске и Минской области
Если на вашем участке запланирована или уже имеется индивидуальная скважина, стоит позаботиться о том, чтобы вода из скважины в дом поступала беспрепятственно, при этом не терялась сила напора. Узнаем, как подключить воду из скважины к дому, какие особенности и тонкости данного процесса.Ввод воды в дом из неглубокой скважины
Если на участке имеется неглубокая скважина, стоит отдать предпочтение автоматизированной системе подачи воды в дом. Она обустроена следующим образом – в воду погружается насосная система, с помощью насоса вода поступает в бак, обычно для таких целей приобретают баки емкостью 100-500 литров.Благодаря тому, что система оснащена реле, насос прекращает свою работу, когда бак заполнен, и напротив, возобновляет, когда вода расходуется. Бак рекомендуется размещать в подсобном помещении. От кессона (конструкция для обустройства рабочей камеры) до дома необходимо прорыть траншею, в нее помещается провод, который будет подавать ток к насосу. Наилучшим выбором будет кабель нагревательного типа, он решит вопрос промерзания труб зимой.Подача воды в дом из глубокой скважины
Как ввести воду в дом из скважины, если на участке имеется глубокая скважина? Если скважина имеет большую глубину (более 9 метров), есть смысл поставить погружной глубинный насос или насос с эжектором, бак располагают на определенной высоте. Благодаря соблюдению этих условий создается давление около 0,1 атмосфер. Бак рекомендуется разместить высоко, например, на втором этаже, рекомендованный объем – от 500 до 1500 литров.Чтобы предотвратить вытекание воды в обратном направлении, стоит обязательно установить клапан обратного действия, его необходимо расположить выше насосной системы. Цена выведения воды в дом из скважины глубокого залегания будет составлять ровно половину ваших затрат, вторая половина предполагает закупку необходимого оборудования.Составление схемы водоотведения из скважины Для того чтобы понять, как ввести воду в дом из скважины, стоит разработать подробную схему. На схематическом рисунке укажите точное расположение точек, соблюдайте масштаб, а также направление трубопровода. Услуга подводки воды в дом из скважины, заказанная у профессионалов, предполагает составление схемы водоотведения специалистами, которые при необходимости смогут выполнить полный комплекс работ, включая ремонт скважин в Минске.Разновидности схем водоотведения Трубы от скважины можно провести двумя способами – коллекторным или последовательным.Последовательное подключение труб при введении воды
Последовательное подключение подходит в том случае, если планируется небольшой расход воды, например, если вдоме будет проживать 1-2 человека. В случае если подводка воды будет осуществляться для большой семьи, такая схема будет неактуальной.Суть последовательного метода заключается в том, что поток воды заходит в дом с помощью основного трубопровода, в точке водоразбора устанавливается тройник, позволяющий пользоваться водой в доме.Коллекторное разведение от скважины Другой способ предполагает подведение воды в дом из бака к каждой точке на схеме, таким образом, удается достичь идентичного давления. Показатель давления может несколько изменяться в зависимости от степени удаленности крана или смесителя от насоса, однако напор в системе будет оставаться достаточным для того, чтобы работали все точки одновременно.Ввод воды из скважины в дом — где заказать услугу в Минске?Чтобы ввод воды из скважины в дом был качественным, и в дальнейшем не было проблем с водоснабжением, стоит воспользоваться услугами профессионалов, а также не экономить на материалах, от этого будет зависеть срок эксплуатации водонапорной системы. Оптимальным решением будет заказ введения воды из скважины в дом в компании «БурАвтоГрупп», воспользуйтесь опытом профессионалов.

Andreiogd Lv 1

Ввод воды из скважины в дом в Минске и Минской области
Если на вашем участке запланирована или уже имеется индивидуальная скважина, стоит позаботиться о том, чтобы вода из скважины в дом поступала беспрепятственно, при этом не терялась сила напора. Узнаем, как подключить воду из скважины к дому, какие особенности и тонкости данного процесса.Ввод воды в дом из неглубокой скважины
Если на участке имеется неглубокая скважина, стоит отдать предпочтение автоматизированной системе подачи воды в дом. Она обустроена следующим образом – в воду погружается насосная система, с помощью насоса вода поступает в бак, обычно для таких целей приобретают баки емкостью 100-500 литров.Благодаря тому, что система оснащена реле, насос прекращает свою работу, когда бак заполнен, и напротив, возобновляет, когда вода расходуется. Бак рекомендуется размещать в подсобном помещении. От кессона (конструкция для обустройства рабочей камеры) до дома необходимо прорыть траншею, в нее помещается провод, который будет подавать ток к насосу. Наилучшим выбором будет кабель нагревательного типа, он решит вопрос промерзания труб зимой.Подача воды в дом из глубокой скважины
Как ввести воду в дом из скважины, если на участке имеется глубокая скважина? Если скважина имеет большую глубину (более 9 метров), есть смысл поставить погружной глубинный насос или насос с эжектором, бак располагают на определенной высоте. Благодаря соблюдению этих условий создается давление около 0,1 атмосфер. Бак рекомендуется разместить высоко, например, на втором этаже, рекомендованный объем – от 500 до 1500 литров.Чтобы предотвратить вытекание воды в обратном направлении, стоит обязательно установить клапан обратного действия, его необходимо расположить выше насосной системы. Цена выведения воды в дом из скважины глубокого залегания будет составлять ровно половину ваших затрат, вторая половина предполагает закупку необходимого оборудования.Составление схемы водоотведения из скважины Для того чтобы понять, как ввести воду в дом из скважины, стоит разработать подробную схему. На схематическом рисунке укажите точное расположение точек, соблюдайте масштаб, а также направление трубопровода. Услуга подводки воды в дом из скважины, заказанная у профессионалов, предполагает составление схемы водоотведения специалистами, которые при необходимости смогут выполнить полный комплекс работ, включая ремонт скважин в Минске.Разновидности схем водоотведения Трубы от скважины можно провести двумя способами – коллекторным или последовательным.Последовательное подключение труб при введении воды
Последовательное подключение подходит в том случае, если планируется небольшой расход воды, например, если вдоме будет проживать 1-2 человека. В случае если подводка воды будет осуществляться для большой семьи, такая схема будет неактуальной.Суть последовательного метода заключается в том, что поток воды заходит в дом с помощью основного трубопровода, в точке водоразбора устанавливается тройник, позволяющий пользоваться водой в доме.Коллекторное разведение от скважины Другой способ предполагает подведение воды в дом из бака к каждой точке на схеме, таким образом, удается достичь идентичного давления. Показатель давления может несколько изменяться в зависимости от степени удаленности крана или смесителя от насоса, однако напор в системе будет оставаться достаточным для того, чтобы работали все точки одновременно.Ввод воды из скважины в дом — где заказать услугу в Минске?Чтобы ввод воды из скважины в дом был качественным, и в дальнейшем не было проблем с водоснабжением, стоит воспользоваться услугами профессионалов, а также не экономить на материалах, от этого будет зависеть срок эксплуатации водонапорной системы. Оптимальным решением будет заказ введения воды из скважины в дом в компании «БурАвтоГрупп», воспользуйтесь опытом профессионалов.

Janob Lv 1

Уважаемые дамы и господа!
В чем прикол кода:2#xjcnkeK4n455jsmnbcs#?

Janob Lv 1

Уважаемые дамы и господа!
В чем прикол кода:2#xjcnkeK4n455jsmnbcs#?